Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-13P0DP09 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms