Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V7

SEC11B, Putative signal peptidase complex catalytic subunit SEC11B, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11BP0C7V7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC11BP0C7V7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms