Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C4AP0C0L4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4AP0C0L4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms