Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC3P02656 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC3P02656 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC3P02656 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC3P02656 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC3P02656 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC3P02656 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC3P02656 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC3P02656 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC3P02656 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC3P02656 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms