Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX58O95786 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX58O95786 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX58O95786 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX58O95786 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX58O95786 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX58O95786 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms