Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24BO95487 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24BO95487 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms