Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG12O94817 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG12O94817 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG12O94817 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG12O94817 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG12O94817 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG12O94817 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG12O94817 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG12O94817 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG12O94817 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG12O94817 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG12O94817 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms