Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLXNC1O60486 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLXNC1O60486 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms