Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPLO60437 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPLO60437 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPLO60437 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPLO60437 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPLO60437 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPLO60437 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPLO60437 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPLO60437 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPLO60437 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PPLO60437 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PPLO60437 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPLO60437 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPLO60437 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPLO60437 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPLO60437 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPLO60437 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPLO60437 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPLO60437 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPLO60437 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPLO60437 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PPLO60437 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PPLO60437 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPLO60437 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPLO60437 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPLO60437 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPLO60437 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPLO60437 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPLO60437 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPLO60437 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPLO60437 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPLO60437 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPLO60437 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPLO60437 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPLO60437 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPLO60437 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPLO60437 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPLO60437 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPLO60437 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPLO60437 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPLO60437 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPLO60437 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPLO60437 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPLO60437 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPLO60437 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PPLO60437 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPLO60437 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PPLO60437 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPLO60437 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPLO60437 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPLO60437 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPLO60437 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms