Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYNGR2O43760 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms