Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKAB2O43741 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms