Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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