Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DIRC3C9JPN6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DIRC3C9JPN6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms