Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN25C9JDP6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN25C9JDP6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms