Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD3A6NKT7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms