Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms