Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PGPEP1LA6NFU8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1LA6NFU8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms