Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms