Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L9A6NEM1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms