Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXA2O43364 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 DHX8-202ENST00000540306 3809 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC068733.1-202ENST00000531479 2456 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 FSD1L-202ENST00000374710 7664 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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HOXA2O43364 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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HOXA2O43364 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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HOXA2O43364 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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HOXA2O43364 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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HOXA2O43364 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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HOXA2O43364 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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HOXA2O43364 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXA2O43364 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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