Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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C9orf172C9J069 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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C9orf172C9J069 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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C9orf172C9J069 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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C9orf172C9J069 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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C9orf172C9J069 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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C9orf172C9J069 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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