Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 PAMR1-207ENST00000619888 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 A2ML1-205ENST00000539547 3460 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 STXBP1-209ENST00000626539 3840 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM213-203ENST00000442682 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4F35P-201ENST00000582957 2876 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CCR6-203ENST00000400926 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-201ENST00000327702 6616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCD1-201ENST00000218104 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD6-201ENST00000344768 2972 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL354919.1-201ENST00000453837 2257 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003355.2-201ENST00000605923 2622 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC37A1-202ENST00000398341 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AVL9-202ENST00000409301 4336 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097382.2-201ENST00000500031 4300 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CNGA2-201ENST00000329903 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GOT2-201ENST00000245206 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 WHRN-204ENST00000374059 3278 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LANCL1-207ENST00000450366 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LGALS8-206ENST00000366584 4369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RSPH10B2-202ENST00000403107 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SSPN-202ENST00000422622 4348 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NUDT5-207ENST00000491614 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF225-206ENST00000592780 2538 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms