Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LTBRP36941 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LTBRP36941 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LTBRP36941 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
LTBRP36941 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
LTBRP36941 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LTBRP36941 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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LTBRP36941 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LTBRP36941 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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