Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ITPKB-IT1-201ENST00000412918 746 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 KRT223P-201ENST00000422957 519 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL929410.1-201ENST00000428250 154 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL353052.1-201ENST00000428673 818 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPP21-223ENST00000436442 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SNX18P2-201ENST00000438540 808 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC242426.2-201ENST00000446956 795 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RN7SL567P-201ENST00000462015 303 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RN7SL402P-201ENST00000465059 264 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC016546.1-201ENST00000473590 463 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ILF2P1-201ENST00000486302 1168 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC087752.3-201ENST00000523905 709 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TRBV7-1-201ENST00000547918 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC018618.1-202ENST00000559590 395 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 KIR3DP1-201ENST00000580853 628 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 FAM95B1-213ENST00000593047 767 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC020908.1-201ENST00000598893 280 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CGA-202ENST00000610310 615 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.149-201ENST00000613165 297 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL662791.5-202ENST00000623946 461 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01835-203ENST00000639800 567 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SH3YL1-205ENST00000403712 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LAX1-202ENST00000367217 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MIPOL1-211ENST00000556451 2282 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ERI2-215ENST00000569729 2646 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TSACC-202ENST00000368252 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MIR503-201ENST00000385270 71 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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