Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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PDK4Q16654 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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PDK4Q16654 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PDK4Q16654 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PDK4Q16654 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PDK4Q16654 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PDK4Q16654 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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