Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR3

KRTAP4-4, Keratin-associated protein 4-4, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-4Q9BYR3 SMAD3-202ENST00000439724 1530 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC01138-209ENST00000639181 1534 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 KANK4-203ENST00000371150 3023 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 MOV10-201ENST00000357443 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 CYP8B1-202ENST00000437102 1896 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 LIMA1-201ENST00000341247 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 ARFGAP2-205ENST00000524782 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 RNF111-202ENST00000557998 4803 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 MDH2-201ENST00000315758 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 SERPINE2-203ENST00000409840 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC10A5-201ENST00000518568 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 TACC1-211ENST00000520973 2564 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 VIPAS39-211ENST00000557658 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 DISP1-201ENST00000284476 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 TTPAL-202ENST00000372904 6234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 PC-202ENST00000393958 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 PIAS3-203ENST00000393045 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 CSMD1-202ENST00000400186 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 CSMD1-217ENST00000602723 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 MLLT3-209ENST00000629733 3264 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 PCSK2-201ENST00000262545 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 NOL4-201ENST00000261592 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 CARMN-201ENST00000505254 3950 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 KBTBD12-204ENST00000407609 4302 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 AL513548.3-201ENST00000611708 2865 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 GLRA2-201ENST00000218075 3216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 ABRAXAS1-201ENST00000321945 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 ATP8A2-204ENST00000381655 9575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 GABRA1-219ENST00000638112 2818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 ALDH1L1-210ENST00000472186 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 UVRAG-207ENST00000531818 3152 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 GRIA1-209ENST00000518783 5233 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 MX1-203ENST00000398600 3470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 SIGLEC10-202ENST00000353836 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 ABCG1-206ENST00000398457 3119 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 EMC3-201ENST00000245046 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 COX15-202ENST00000370483 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 HMOX2-203ENST00000406590 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 AC110053.1-201ENST00000523156 1744 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 MOV10L1-205ENST00000395858 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 ATP1A3-207ENST00000543770 3427 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 TCTN3-201ENST00000265993 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 HDC-201ENST00000267845 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 STAU2-214ENST00000521451 2712 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 CBLL1-205ENST00000440859 4432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 GPR156-203ENST00000464295 4442 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 ICK-201ENST00000350082 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 F11-203ENST00000403665 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 SLAMF7-205ENST00000444090 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 BRCA1-219ENST00000491747 2379 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 TMPRSS7-205ENST00000617607 2377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 KIAA0930-202ENST00000336156 8119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 NPY1R-201ENST00000296533 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC00664-202ENST00000596718 3029 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 HAO2-205ENST00000622548 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 DNAJA4-201ENST00000343789 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC4A1AP-204ENST00000613058 2966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 ATAD1-201ENST00000308448 4640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 GSTCD-211ENST00000515279 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 PTK2B-210ENST00000517339 3914 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 TRPM1-201ENST00000256552 5514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 STXBP5-AS1-201ENST00000367477 2927 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 TSPAN1-201ENST00000372003 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 CSGALNACT1-203ENST00000454498 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC00934-202ENST00000630357 2291 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-4Q9BYR3 SEMA4D-202ENST00000356444 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.9 ms