Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S4R3C0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S4R3C0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S4R3C0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
S4R3C0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S4R3C0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S4R3C0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S4R3C0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S4R3C0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S4R3C0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms