Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms