Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms