Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms