Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms