Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms