Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK97

FBXO9, F-box only protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO9Q9UK97 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXO9Q9UK97 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXO9Q9UK97 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXO9Q9UK97 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms