Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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RABGEF1Q9UJ41 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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RABGEF1Q9UJ41 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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RABGEF1Q9UJ41 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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RABGEF1Q9UJ41 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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RABGEF1Q9UJ41 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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