Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNOT7Q9UIV1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT7Q9UIV1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms