Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms