Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFIP11Q9UBB9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFIP11Q9UBB9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms