Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNTN3Q9P232 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNTN3Q9P232 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNTN3Q9P232 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNTN3Q9P232 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN3Q9P232 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN3Q9P232 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN3Q9P232 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN3Q9P232 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN3Q9P232 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN3Q9P232 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNTN3Q9P232 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms