Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HCN3Q9P1Z3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms