Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PODXL2Q9NZ53 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms