Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GDAP2Q9NXN4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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