Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOR4AQ9NXH8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms