Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3AQ9NVI7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms