Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMSN1Q9NSI8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMSN1Q9NSI8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms