Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms