Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms