Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRHQ9HD43 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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