Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF2Q9HAU5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms