Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXO5Q9H790 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXO5Q9H790 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms