Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms